二代測序（Next-Generation Sequencing，NGS）是指使用高通量平臺同時對大規模DNA或RNA進行快速、準確、低成本的測序技術。在這個過程中，二代測序酶起到了重要作用。

　　二代測序酶主要分為兩類：聚合酶和核苷酸轉移酶。

　　1. 聚合酶

　　聚合酶是進行DNA擴增的關鍵工具，在PCR (Polymerase Chain Reaction) 過程中發揮著重要作用。其中最常見的是Taq DNA polymerase和Phusion DNA Polymerase兩種。

　　Taq DNA polymerase即熱穩定型聚合酶，能夠耐受較高溫度條件下的反應，并且擴增產物含有A尾巴（Adenines），適用于目標片段長度較短且含有AT富集區域時使用；而Phusion DNA Polymerase則由多個不同來源的DNA polymerases組成復雜結構體系，在保證特異性與靈敏度基礎上, 具備更好的擴增效率、精準性及拓展模板長度等優點。

　　2. 核苷酸轉移 酶

　　核苷轉移脫氧核糖體（Nucleotide Transfer and Deoxyribonucleotide Transfer）也稱為內切酶，是一類蛋白質酶，在DNA測序過程中扮演著重要的角色。這些內切酶可以短小地識別和結合到DNA上，并在特定核苷酸位點處水解化學鍵，釋放出部分堿基或其它標記物。

　　總之, 二代測序酶作為高通量平臺進行快速、準確、低成本的基因組學研究所必備的關鍵工具, 具有極其重要和不可替換的作用。